采用Arraystar lncRNA芯片发现病毒型肝癌的新靶点-技术前沿-资讯-生物在线

采用Arraystar lncRNA芯片发现病毒型肝癌的新靶点

作者:上海康成生物工程有限公司 2011-08-03T00:00 (访问量:7238)

第二军医大学孙树汉教授课题组长期致力于肝癌研究,许多实验成果已经发表在国际顶级期刊上。此次研究利用Arraystar lncRNA芯片(长链非编码RNA芯片)对肝癌及癌旁组织进行系统性筛查,发现lncRNA-HEIH在乙型肝炎病毒(HBV)导致的肝癌(HCC)发生中起重要作用,研究成果发表在Hepatology。

此次研究中lncRNA芯片实验在康成生物公司完成

Yang, F., et al., Long non-coding RNA high expressed in hepatocellular carcinoma (lncRNA-HEIH) facilitates tumor growth through enhancer of zeste homolog 2. Hepatology, 2011. (影响因子:10.885)

文章首先通过Arraystar公司的LncRNA芯片对HBV导致的肝癌组织(n=5)及癌旁组织(n=5)中的长链非编码RNA进行了系统的检测与比较,并且通过50对标本的进一步qPCR验证,找到了一组癌与癌旁中差异表达的lncRNA。实验者特别关注一个在癌组织中特异性高表达的新LncRNA(lncRNA-HEIH:lncRNA High Expression in HCC)。

实验者进一步研究lncRNA-HEIH与肝癌之间的功能联系。通过与病人生存时间等临床数据进行关联分析,发现lncRNA-HEIH的表达水平可以作为病人生存时间的预测标志,并且和癌症的复发有很强的相关性。对lncRNA-HEIH的功能研究发现它在细胞周期调控中起重要作用,它可能通过与EZH2结合来募集PRC2,进而抑制下游靶基因的表达从而发挥其调控功能。这些结果表明lncRNA-HEIH有望成为病毒型肝癌的一个新的早期诊断标志或治疗靶点。

图示:肝癌(n=5)和癌旁组织(n=5)的芯片聚类结果。Arraystar公司的lncRNA芯片同时设计了mRNA与lncRNA,图A为差异表达的254个mRNA聚类结果,图B为差异表达的174个lncRNA聚类结果。红色代表上调,绿色代表下调。

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