靶向蛋白质组学（Targeted Proteomics）专注于特定蛋白质或蛋白质组的高精度定量分析，广泛应用于生物医学研究、临床诊断和药物开发。不同于发现型蛋白质组学（Discovery Proteomics），靶向蛋白质组学采用假设驱动的方式，在复杂生物样本中精准检测低丰度蛋白质，提供更高的特异性和定量精度。

一、靶向蛋白质组学的方法

1、 经典靶向定量方法

（1）选择反应监测（SRM/MRM）

基于三重四极杆质谱（Triple Quadrupole MS）的选择反应监测（Selected Reaction Monitoring, SRM）或多反应监测（Multiple Reaction Monitoring, MRM）是经典靶向技术。其原理是通过预先设定母离子（precursor ion）和特征子离子（product ion）的质荷比（m/z），仅采集目标肽段的信号，从而排除复杂样本中的背景干扰。SRM/MRM的灵敏度可达飞摩尔（fmol）级别，适用于低丰度蛋白质（如血浆中的生物标志物）的绝对定量。

（2）平行反应监测（PRM）

平行反应监测（Parallel Reaction Monitoring, PRM）基于高分辨率质谱（如Orbitrap），在一次扫描中同时捕获目标肽段的所有子离子，再通过后处理筛选特征碎片。相比SRM，PRM无需预先定义子离子，灵活性更高，且可通过全扫描数据回溯分析未预设的目标，适合复杂样本中多目标蛋白的同步检测。

2、非经典靶向策略

（3）数据非依赖采集（DIA）结合靶向数据提取

尽管数据非依赖采集（Data-Independent Acquisition, DIA）常被归类为“非靶向”技术，但其通过将质谱扫描窗口分割为固定区间，可实现对全蛋白质组的系统性覆盖。结合谱图库（Spectral Library）或深度学习算法，DIA数据可被重新提取用于靶向分析，兼具高通量与可回溯性的优势。

二、应用领域

1、生物标志物的精准验证

靶向蛋白质组学能够在不同组织或体液样本中精确定量候选生物标志物，为癌症、神经退行性疾病及代谢疾病的早期诊断和治疗提供数据支持。

2、药物研发与靶点验证

靶向蛋白质组学可用于评估药物与靶蛋白的相互作用，监测药物处理前后的蛋白质表达变化，从而优化药物开发策略，提高药效预测能力。

3、疾病机制研究

通过定量分析疾病相关蛋白及其翻译后修饰情况，靶向蛋白质组学可以揭示疾病发生发展的关键调控机制，如炎症反应、代谢调节和信号通路异常。

4、精准医学与个性化治疗

可用于检测患者体内特定蛋白质的表达水平，从而制定个性化治疗方案，提高治疗效果，降低副作用。

三、挑战与未来发展方向

尽管靶向蛋白质组学在生命科学研究中展现出巨大的应用潜力，但仍面临一些挑战，包括：

1、检测灵敏度和动态范围的提升

针对低丰度蛋白的检测仍然是一个技术难点，需要不断优化前处理方法和质谱仪性能。

2、标准化与数据重复性

由于不同实验室的质谱平台和数据分析方法存在差异，建立标准化的实验流程和数据分析规范是当前研究的重点。

3、数据分析复杂度

随着大规模蛋白质组学数据的积累，如何有效整合和解读数据仍然是生物信息学面临的挑战。

随着人工智能和机器学习的引入，靶向蛋白质组学数据分析将更加精准。此外，多组学整合（如基因组学、转录组学、代谢组学）将进一步推动靶向蛋白质组学的应用，助力精准医学的发展。百泰派克生物科技（BTP）采用ISO9001质量控制体系，获国家CNAS实验室认可，提供高灵敏度、高特异性的蛋白质定量分析服务。我们的靶向蛋白质组学平台涵盖：

• MRM/SRM 和 PRM 质谱定量分析
• 稳定同位素标记定量（SILAC、TMT/iTAQ）
• 翻译后修饰蛋白定量（磷酸化、乙酰化、糖基化等）
• 蛋白互作与通路分析

凭借丰富的经验和专业的分析能力，BTP致力于为科研人员和企业客户提供定制化的蛋白质组学解决方案。欢迎联系我们，了解更多靶向蛋白质组学服务详情！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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