人snp芯片,人snp基因组芯片,Human omni-1 quad芯片
产品名称： 人snp芯片,人snp基因组芯片,Human omni-1 quad芯片
英文名称： Human omni-1 quad芯片
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上海仪方生物技术有限公司
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芯片信息: Human omni-1 quad芯片数据来自于人类千人基因组计划测序结果。其中包含了超过114万个探针信息，可以在一张芯片上平行进行4个样本的检测。该款芯片包含针对基因SNPs，标签SNPs，拷贝数变化（CNV）, 及其他高价值的基因组区基因组区域域设计探针。
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| 标签Tag SNPs：根据HapMap挑选标签SNP，在r2 > 0.8 前提下，Caucasian(CEU)，Han Chinese/Japanese (CHB/JPT)和Yoruba (YRI)人种中基因组覆盖率分别为95%，94%和85%。提供了最高限度的基因组覆盖率，在基因组中平均间隔为2.4kb。 |
| CNV区域：探针覆盖了CNV高发区域如片段复制区 域，megasatellites，SNP沙漠，MHC区；覆盖Database of Genomic Variants(DGV)数据库中已报导的CNV区域;特有探针覆盖DGV数据库中尚未报导的CNV区域。在超过6,000个常见及5,000个罕见的 CNV区域内，平均每个CNV区域分布10-15个位点，平均1.2 kb。 |
| 在该芯片所覆盖的SNP位点中有18,000个SNP覆盖了通过GWAS研究得到的与人类疾病相关的主要区域，50,000个非同意SNPs，有62,000个SNPs覆盖100个插入缺失周边区域。 |
| ADME(Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion)基因：包含ADME基因中的22,429 SNP。 |
| MHC区域：包含19,081个SNP标记和495个indel 标记。 |
| 性染色体：27,493个 X 染色体位点, 2,322个Y染色体位点, 1,157伪常染色体区(PAR)SNP位点。 |
| 线粒体 SNP：27 mtSNP。 |
| 产品名称： Human omni-express beadchip |
| 芯片信息：Human omni-express 芯片覆盖人类基因组计划HapMap三个阶段研究的数据，针对基因SNPs，标签SNPs，拷贝数变化（CNV），及其他高价值的基因组区域设计探针. |
| 共700,000多个位点，每张芯片可同时检测12个样本。在r2 > 0.8 前提下，在CEU，JPT+CHB，YRI等人种中基因组覆盖率分别为：0.91，0.91，0.68。CNV区域平均间隔4.0kb。 |